MSI wurde entwickelt, damit IT-Abteilungen die App im gesamten Unternehmensnetzwerk massenweise bereitstellen können. Automatische Aktualisierungen werden von MSI von Haus aus nicht unterstützt. Dadurch kann die IT genau steuern, welche App-Version auf den Rechnern des Unternehmens installiert ist. Die App-Dateien werden im Verzeichnis "Programme" installiert und sind für alle Benutzer auf dem Computer zugänglich.
MSI ist für die Bereitstellung mit Tools wie Microsoft Active Directory GPO, Microsoft SCCM und Microsoft Intune gedacht Für die Installation sind Administratorrechte erforderlich.
Das EXE-Installationsprogramm ist für die Installation für einzelne Benutzer vorgesehen. Es erfordert keine Administratorrechte für die Installation, unterstützt automatische Aktualisierungen und ist nur für den Benutzer zugänglich, der die EXE-Datei installiert hat. Die App-Dateien werden im Benutzerprofilverzeichnis installiert. Mit Bereitstellungstools wie Microsoft Active Directory GPO, Microsoft SCCM und Microsoft Intune kann der EXE-Installer nicht ordnungsgemäß ausgeführt werden, da diese Tools EXE-Dateien standardmäßig im Namen von Systembenutzern mit erhöhten Berechtigungen ausführen. Dieser Installationsmodus wird von EXE nicht unterstützt.